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國(guó)家基因庫(kù)發(fā)起“千種魚(yú)轉(zhuǎn)錄組計(jì)劃”

更新時(shí)間:2013-11-22      瀏覽次數(shù):1511

11月19日,深圳國(guó)家基因庫(kù)宣布“千種魚(yú)轉(zhuǎn)錄組計(jì)劃”(Fish T1K)正式啟動(dòng)。該項(xiàng)目旨在解密魚(yú)類(lèi)起源、進(jìn)化、生殖、發(fā)育、性別調(diào)控和免疫等活動(dòng)機(jī)制,以更好應(yīng)對(duì)魚(yú)類(lèi)育種、疾病防控、海洋食品安全和生物多樣性保護(hù)等帶來(lái)的諸多挑戰(zhàn)。項(xiàng)目計(jì)劃在未來(lái)3~5年內(nèi)完成約1000種魚(yú)類(lèi)轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序、組裝工作,并構(gòu)建高質(zhì)量的魚(yú)類(lèi)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息平臺(tái)。

 

相對(duì)于其他魚(yú)類(lèi)轉(zhuǎn)錄組研究,千種魚(yú)轉(zhuǎn)錄組計(jì)劃規(guī)模大、學(xué)科交叉廣、綜合性強(qiáng),在范圍內(nèi)尚屬*。

 

該項(xiàng)目產(chǎn)出的所有數(shù)據(jù)將通過(guò)國(guó)家基因庫(kù)公開(kāi),以保證科學(xué)家可以實(shí)時(shí)掌握魚(yú)類(lèi)研究動(dòng)態(tài)及RNA-seq測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用。

 

據(jù)介紹,到目前為止,僅有約10種魚(yú)類(lèi)的基因組被公開(kāi)報(bào)道。此外,在NCBI公共數(shù)據(jù)庫(kù)中僅有80多種魚(yú)類(lèi)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。

 

國(guó)家基因庫(kù)海洋分庫(kù)負(fù)責(zé)人、該項(xiàng)目帶頭人孫穎認(rèn)為:“T1K項(xiàng)目將建立*專(zhuān)門(mén)針對(duì)魚(yú)類(lèi)組學(xué)研究的性合作網(wǎng)絡(luò),并將大大深化我們對(duì)魚(yú)類(lèi)的比較生理學(xué)、生物地理學(xué)認(rèn)識(shí),促進(jìn)魚(yú)類(lèi)資源醫(yī)用價(jià)值的挖掘、經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價(jià)值的開(kāi)發(fā),以及生物多樣性保護(hù)等問(wèn)題的解決。”

 

《中國(guó)科學(xué)報(bào)》 (2013-11-21 第1版 要聞)

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