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中美科學(xué)家合作成功繪制大鼠基因功能圖譜

更新時(shí)間:2014-02-18      瀏覽次數(shù):1415

    復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院石樂(lè)明教授和博士研究生郁穎、博士后趙琛等,與美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局國(guó)家毒理學(xué)研究中心、羅馬林達(dá)大學(xué)等單位合作,經(jīng)兩年多時(shí)間攻關(guān),成功繪制出涵蓋11種器官和4個(gè)發(fā)育階段的大鼠基因功能圖譜。

     這一成果對(duì)藥物安全性評(píng)價(jià)和個(gè)性化醫(yī)療具有重要意義;近日在雜志《自然·通訊》上發(fā)表,引起學(xué)界普遍關(guān)注。相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)通過(guò)網(wǎng)絡(luò)開(kāi)放以方便廣大科研工作者、藥企等共享。

     據(jù)悉,小鼠適合遺傳學(xué)研究,大鼠的生物表現(xiàn)行為更貼近人類,更適合用來(lái)模擬人類疾病,進(jìn)行藥物安全性、代謝機(jī)理、潛在的藥物風(fēng)險(xiǎn)和化學(xué)毒性評(píng)估等研究。

    石樂(lè)明教授課題組和他的合作者,運(yùn)用RNA測(cè)序技術(shù),對(duì)“Fisher344大鼠”的幼年、青春期、成年及老年基因進(jìn)行測(cè)試,涵蓋11種器官的320個(gè)樣本,繪制出了目前世界上zui完整的大鼠基因功能圖譜。

     為證明圖譜的可靠性,課題組專門驗(yàn)證了美國(guó)專業(yè)基因功能數(shù)據(jù)庫(kù)(AceView)以往所注釋的眾多有生物功能的基因,并繪制出40064個(gè)基因和65167種有生物功能的基因變種的表達(dá)譜,其中包括31909種選擇性剪接轉(zhuǎn)錄變異體和2367種非編碼基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn),大鼠中存在著大量人類以前并未認(rèn)識(shí)到的功能基因,組織與組織之間所表達(dá)的基因數(shù)量不同,不同年齡段基因數(shù)量不同,雌雄之間組織器官表達(dá)的基因數(shù)量和功能也不同,并發(fā)現(xiàn)有些基因會(huì)根據(jù)不同情況發(fā)揮不同作用,如有許多基因只在某些特定的組織器官、不同年齡段以及不同性別上發(fā)揮作用。掌握這些信息,有助于科學(xué)家根據(jù)不同器官、不同年齡段以及不同性別等基因差異,深入研究藥物,更有助于推動(dòng)個(gè)性化給藥方式。(轉(zhuǎn)自 新華網(wǎng))

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